La Iniciativa per a Malalties Tropicals (TDI, per les sigles en anglès) publica importants resultats de lliure accés (open source), facilitant així col·laboracions per al descobriment de fàrmacs contra les malalties tropicals.

Les iniciatives convencionals per al desenvolupament de fàrmacs, basat en el sistema de patents, no resulta productiu per als països en vies de desenvolupament (PVD), on el mercat comercial es entre petit e inexistent. Per aquest motiu, a la dècada passada sorgiren abundants alternatives institucionals de R+D (Recerca i desenvolupament) com les aliances públic-privades o el sistema de premis a la innovació. Tot i així, malgrat l’extens debat, una de les alternatives més prometedores –el descobriment de fàrmacs en sistemes de lliure accés de dades- , exceptuant accions puntuals, ha restat immòbil. Des de la Iniciativa per a Malalties Tropicals (TDI, per les sigles en anglès) al·ludeixen que el principal obstacle per a l’avenç d’aquestes iniciatives ha estat l’absència d’una bona base de treballs previs que els col·laboradors voluntaris poden millorar mitjançant un seguit de contribucions puntuals.

Avui dia, tot i que per a les malalties oblidades, hi ha una gran falta de potencials fàrmacs en desenvolupament, així com de proteïnes d’alta qualitat identificades com diana de fàrmacs coneguts, afortunadament, hi ha abundants genomes d’organismes causants d’aquestes malalties que ja han sigut seqüenciats i publicats. En base a aquestes informacions de seqüència i en el marc de la TDI, diversos investigadors d’un total de 7 grups d’investigació ubicats a València (España), San Francisco (Califòrnia, EEUU), Dirham (Carolina del Nord, EEUU), San Ramon (Califòrnia, EEUU) i Sidney (Austràlia), han dut a terme un estudi publicat recentment a la revista científica d’accés lliure PLoS neglected tropical diseases.

L’estudi es basa en mètodes computacionals amb els que es realitzà: un modelatge comparatiu d’estructures de proteïnes diana, la predicció de la localització del lloc d’interacció amb el lligand i l’avaluació de les semblances dels lligands predits amb fàrmacs ja coneguts. La seva aportació a la font de dades resulta en 143 i 297 proteïnes diana dels genomes dels deu patògens, de les quals es preveu que s’uneixin amb fàrmacs coneguts, o molècules semblants a fàrmacs coneguts, respectivament. Així doncs, l’estudi ofereix una font de fàrmacs potencials i fàrmacs candidats en base a la qual es pot centrar una comunitat d’accés obert. L’estudi, a més a més, inclou l’assaig experimental mitjançant RMN (Ressonància Magnètica Nuclear), amb el qual provaren les seves prediccions per a dos de les proteïnes diana, confirmant-ne una d’elles e invalidant-ne l’altra.

Les aportacions de TDI s’han publicat sota una llicència Creative Commons per a l’ús lliure i sense restriccions, i són accessibles a World Wide Web a http://www.tropicaldisease.org. Aquesta publicació s’ha realitzat amb l’esperança que aquesta llavor faciliti la col·laboració en els esforços per al descobriment de nous fàrmacs contra paràsits que causen malalties tropicals.

Font:
Leticia Ortí, Rodrigo J. Carbajo2, Ursula Pieper3, Narayanan Eswar, Stephen M. Maurer, Arti K. Rai, Ginger Taylor, Matthew H. Todd, Antonio Pineda-Lucena, Andrej Sali, Marc A. Marti-Renom. A Kernel for Open Source Drug Discovery in Tropical
Diseases. PLoS Neglected Tropical Diseases. April 2009. Volume 3. Issue 4. e418